Florian Bayer war von Juli 2009 bis Ende Februar 2013 wissenschaftlicher Mitarbeiter an der "Forschungsstelle Geschichte des Rundfunks in Norddeutschland" des Hans-Bredow-Instituts, in Kooperation mit der Universität Hamburg und des NDR. Hier arbeitete er insbesondere an Projekten zur medialen Berichterstattung über die NS-Prozesse der 1950er und 1960er Jahre, einer fortlaufend aktualisierten Bibliografie zum Norddeutschen Rundfunk sowie Zeitzeugenbefragungen zur Rundfunkgeschichte.